Как отмечается в документе, внедрение системы вызвано необходимостью уменьшить число возмещений НДС российскими экспортерами. По данным правительства, в настоящее время в России рост возмещения НДС более чем в два раза превышает рост объемов экспорта. Это приводит к значительным потерям бюджета.
Функционирование системы межведомственного обмена данными в реальном времени между таможенными и налоговыми органами позволит более действенно контролировать экспорт и суммы, которая предъявляется чтобы произвести возмещение НДС. Другими словами, система контроля поможет налоговым и таможенным органам противодействовать неправомерному возмещению НДС при экспорте товаров. Если налоговики будут своевременно получать необходимые достоверные сведения от таможни, решатся многие вопросы. Например, уменьшатся сроки проведения мероприятий в рамках контроля правомерности применения нулевой ставки НДС, повысится надежность и правомерность такого возмещения.