Выплату можно списать в состав прочих расходов, связанных с производством и реализацией (пп. 49 п. 1 ст. 264 НК РФ).
Если ваш работник из командировки может каждый день возвращаться домой, то суточные ему не положены (п.11 Положения о служебных командировках). Тем не менее, возмещать сотруднику деньги, хоть и на однодневную командировку, компания все-таки должна. Соответственно, выплату можно списать в состав прочих расходов, связанных с производством и реализацией (пп.49 п.1 ст.264 НК РФ). Это подтвердили чиновники в письме Минфина от 01.08.2013 г. № 03-03-06/1/30805. Главное, чтобы порядок и размеры компенсации расходов на такие командировки были прописаны в коллективном договоре или локальном нормативном акте.
Кстати, напомним, что недавно чиновники финансового ведомства в своем письме от 01.03.2013 г. № 03-04-07/6189 разрешили не удерживать НДФЛ с тех денег, которые компания выдает работнику на однодневную командировку.