Такая особенность нумерации не мешают идентифицировать продавца, покупателя, наименование товаров.
Нумеровать счета-фактуры, а также корректировочные счета-фактуры правильно в общем хронологическом порядке. Ежедневная нумерация документов с первого порядкового номера не предусмотрена в постановлении Правительства от 26.12.2011 г. № 1137.
Однако такая особенность нумерации не мешают идентифицировать продавца, покупателя, наименование товаров и т.п. А значит, отказать в вычете НДС по такому счету-фактуре налоговики не вправе. Это подтвердил Минфин в письме от 11.10.2013 г. № 03-07-09/42466.