НДС претензия транспортные услуги

[Дядя Ешта]

Добрый день! Ситуация такая транспортная компания довезла до склада не весь товар(поврежден) компания на ОСНО т.е счета выставляет с НДС, Претензию за недостачу товара выставили транспортной компании платить они должны с НДС или Без ??