Исправления в декларации по НДС 2015г.

[ОляВлад]

Добрый день, помогите пожалуйста, начинающему бухгалтеру.

такая ситуация - в июне месяце мне дали сч-фактуру с одними данными (2 квартал) , прошло время и сейчас после получения требования из налоговой с требованием пояснений выяснилось, что поставщик первоначально не учел скидку. В течение 2 квартал они документ поменяли, а нас не предупредили и не дали новый документ (хотя они утверждают, что давали и мы их потеряли).
Теперь заканчивается 3-ий квартал и как мне быть?

Подавать корректировачную декларацию по НДС за 2 квартал? и если ее подавать, то изменить надо всю книгу покупок или только добавить доп лист?